Điều 12. - Về quản lý giao thông đường biển:
1. Tổ chức quản lý, khai thác các hệ thống hoa tiêu, báo hiệu các đường hàng hải. Hiệp đồng chặt chẽ với các tổ chức Hàng hải các quốc gia lân cận trong việc điều hành tàu biển Việt Nam và tàu biển các nước hoạt động trên vùng Hàng hải thuộc trách nhiệm của Việt Nam.
2. Phối hợp với các cơ quan, đơn vị vũ trang của Bộ quốc phòng, Bộ Nội vụ trong việc quản lý và bảo vệ lãnh hải, vùng đặc quyền kinh tế của Việt Nam.
3. Cấp phép ra, vào, neo đậu tại các vùng nước cảng biển và luồng ra vào các cảng biển Việt Nam và xử lý những vi phạm quy chế vùng và luồng ra vào các cảng biển Việt Nam.
4. Cung cấp các loại bản đồ hàng hải, tài liệu về giao thông hàng hải, thông tin hàng hải, hoa tiêu hàng hải, khí tượng hàng hải và tổ chức việc tìm kiếm cứu nguy tàu biển liên quan đến vùng hàng hải thuộc trách nhiệm của Việt Nam.
5. Chỉ đạo việc quy hoạch, xây dựng hệ thống thông tin, báo hiệu hàng hải.
6. Là thành viên của Uỷ ban tìm kiếm cứu nạn quốc gia, chủ trì việc phối hợp với các cơ quan khác trong việc tìm kiếm cứu nạn hàng hải.