Điều 12. Tổ chức hợp tác dùng nước ngoài việc thực hiện nhiệm vụ và quyền quy định tại Điều 17, Điều 18 Pháp lệnh Khai thác và bảo vệ công trình thuỷ lợi; Điều 9 Nghị định số 143/2003/NĐ-CP của Chính phủ, Nghị định số 115/2008/NĐ-CP ngày 14/11/2008, Nghị định số 72/2007/NĐ-CP ngày 07/5/2007 về quản lý an toàn đập còn có các quyền và nhiệm vụ sau:
1. Trực tiếp đóng, mở cống đã được phân cấp quản lý để điều hoà, phân phối nước công bằng, hợp lý phục vụ sản xuất cho các tổ chức, cá nhân sử dụng nước theo hợp đồng đã ký kết.
2. Kiến nghị với UBND xã, phường, thị trấn phối hợp trong việc lập sổ bộ tưới, ký kết hợp đồng, thu tiền đóng góp của người hưởng lợi và nghiệm thu kết quả tưới đến từng tổ chức, cá nhân sử dụng nước, làm cơ sở thanh lý, thanh toán cấp bù thuỷ lợi phí.
3. Theo dõi, phát hiện và xử lý kịp thời các sự cố nhằm bảo đảm an toàn công trình. Khi có thiên tai xảy ra phải phối hợp kịp thời với Công ty TNHH một thành viên Khai thác CTTL lập hồ sơ trình cấp có thẩm quyền phê duyệt hỗ trợ kinh phí, ngày công lao động để khắc phục.
4. Tổ chức bảo vệ, ngăn chặn những hành vi xâm phạm làm hư hỏng công trình thuỷ lợi đã được phân cấp quản lý. Kiến nghị với chính quyền địa phương và các ngành liên quan xử lý kịp thời theo pháp luật các trường hợp vi phạm, phá hoại công trình, gây lãng phí nước, tranh chấp về nước tưới.
5. Kiến nghị các cấp có thẩm quyền hoặc yêu cầu toà án nhân dân giải quyết trong trường hợp Công ty TNHH một thành viên KTCTTL Quảng Ngãi không thực hiện đúng các cam kết trong hợp đồng gây thiệt hại cho tổ chức hợp tác dùng nước, tổ chức, cá nhân sử dụng nước.
6. Được đào tạo, tập huấn chuyên môn nghiệp vụ, kỹ năng quản lý khai thác và bảo vệ công trình thuỷ lợi.
7. Quản lý, công khai việc chi tiêu nguồn kinh phí phục vụ quản lý công trình thủy lợi và thực hiện đúng nguyên tắc quản lý ngân sách nhà nước đối với các nguồn kinh phí do nhà nước cấp.