Điều 12. Lãnh đạo một Trường Đại học thành viên thuộc Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh là Hiệu trưởng. Lãnh đạo một Viện nghiên cứu thuộc Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh là Viện trưởng.
Hiệu trưởng, Viện trưởng do Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo ra quyết định bổ nhiệm và miễn nhiệm, theo đề nghị của Giám đốc Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh.
Hiệu trưởng, Viện trưởng chịu trách nhiệm lãnh đạo, tổ chức thực hiện mọi nhiệm vụ được quy định cho đơn vị mình.
Hiệu trưởng, Viện trưởng có nhiệm kỳ là 4 năm và không được giữ quá hai nhiệm kỳ liên tục.
Giúp việc cho Hiệu trưởng, Viện trưởng là các Phó hiệu trưởng, Phó viện trưởng. Giám đốc Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh căn cứ vào đề nghị của Hiệu trưởng, Viện trưởng để lựa chọn Phó hiệu trưởng, Phó viện trưởng và báo cáo Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo trước khi bổ nhiệm, miễn nhiệm. Phó hiệu trưởng, Phó viện trưởng, có cùng nhiệm kỳ công tác theo nhiệm kỳ của Hiệu trưởng, Viện trưởng.