Điều 10. Lãnh đạo Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh là Giám đốc. Giám đốc Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh do Thủ tướng Chính phủ bổ nhiệm và miễn nhiệm theo đề nghị của Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo. Giám đốc Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh chịu trách nhiệm trước Thủ tướng Chính phủ và Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo về hoạt động của Đại học Quốc gia thành phố Hồ Chí Minh. Giám đốc có nhiệm kỳ 4 năm và không giữ quá 2 nhiệm kỳ liên tục.
Giúp việc Giám đốc là các Phó Giám đốc được Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo bổ nhiệm và miễn nhiệm theo đề nghị của Giám đốc. Nhiệm kỳ của các Phó giám đốc theo nhiệm kỳ của Giám đốc.