Điều 7. Tổ chức Thanh tra Bộ gồm có:
Chánh Thanh tra Bộ.
Các Phó Chánh thanh tra Bộ, trong đó có 1 phó Chánh Thanh tra Bộ được phân công làm nhiệm vụ thường trực.
Các thanh tra viên.
Các cán bộ, chuyên viên.
Thanh tra Bộ làm việc theo chế độ thủ trưởng. Thanh tra viên và cán bộ, chuyên viên làm việc trực tiếp với Chánh, phó Chánh thanh tra Bộ.
Chánh Thanh tra Bộ chịu trách nhiệm trực tiếp trước Bộ trưởng, đồng thời chịu trách nhiệm trước Tổng Thanh tra Nhà nước về toàn bộ công tác thanh tra trong phạm vi quản lý Nhà nước của Bộ.
Phó Chánh Thanh tra là người giúp việc Chánh Thanh tra và thực hiện nhiệm vụ do Chánh Thanh tra phân công; chịu trách nhiệm trước Chánh Thanh tra về những công việc đó.
Phó Chánh Thanh tra thường trực được uỷ quyền của Chánh Thanh tra giải quyết và điều hành công việc chung của Thanh tra Bộ khi Chánh Thanh tra vắng mặt.
Thanh tra Bộ được sử dụng cộng tác viên trong hoạt động Thanh tra theo quy định của Chính phủ.
Trong hoạt động thanh tra, Thanh tra Bộ được sử dụng con dấu riêng theo mẫu chung của Thanh tra Nhà nước. Khi cần thiết, sử dụng con dấu của Bộ Giao thông vận tải.