Điều 12. Tổ chức Thanh tra Cục gồm có:
Chánh Thanh tra Cục
Phó Chánh Thanh tra Cục
Thanh tra viên và một số cán bộ, chuyên viên.
Thanh tra Cục làm việc theo chế độ thủ trưởng. Thanh tra viên và cán bộ, chuyên viên làm việc trực tiếp với Chánh, Phó Chánh thanh tra Cục.
Chánh Thanh tra Cục chịu trách nhiệm trực tiếp trước Cục trưởng, đồng thời chịu trách nhiệm trước Chánh Thanh tra Bộ về toàn bộ công tác thanh tra trong phạm vi quản lý Nhà nước của Cục.
Phó Chánh Thanh tra Cục là người giúp việc Chánh Thanh tra Cục và thực hiện nhiệm vụ do Chánh Thanh tra Cục phân công và chịu trách nhiệm trước Chánh Thanh tra Cục về những công việc đó.
Thanh tra Cục được sử dụng cộng tác viên trong hoạt động thanh tra theo quy định của Chính phủ.
Trong hoạt động thanh tra, Thanh tra Cục được sử dụng con dấu riêng theo đúng mẫu chung của Thanh tra Nhà nước.
Việc bổ nhiệm, miễn nhiệm Chánh Thanh tra Cục do Cục trưởng đề nghị Chánh Thanh tra Bộ trình Bộ trưởng quyết định.
Việc bổ nhiệm, miễn nhiệm Phó Chánh Thanh tra Cục do Chính Thanh tra Cục đề nghị Cục trưởng quyết định.
Chánh Thanh tra Cục, Phó Chánh Thanh tra Cục phải là người đủ tiêu chuẩn thanh tra viên theo quy định của Quy chế thanh tra viên.
Việc bổ nhiệm, miễn nhiệm thanh tra viên ở thanh tra Cục thực hiện theo quy chế Thanh tra viên được ban hành kèm theo Nghị định 191-HĐBT (nay là Chính phủ) ngày 18-6-1991.
Bộ máy của Thanh tra Cục do Cục trưởng quyết định sau khi được sự thoả thuận của Chánh thanh tra Bộ.