Điều 12 .- Giám đốc Học viện Quốc phòng hàng năm giao nhiệm vụ thu chi ngân sách cho các đơn vị thuộc quyền, bảo đảm hoạt động của Học viện Quốc phòng hoàn thành chức năng, nhiệm vụ, mục tiêu của kế hoạch đã được Nhà nước duyệt, đồng thời phải chịu trách nhiệm trước Bộ Quốc phòng và Chính phủ về quản lý toàn diện thu chi ngân sách của Học viện Quốc phòng.
Giám đốc Học viện Quốc phòng chỉ đạo, hướng dẫn, kiểm tra các đơn vị thuộc quyền sử dụng kinh phí theo đúng chế độ, tiêu chuẩn, định mức, đơn giá của Bộ Quốc phòng và Nhà nước, cuối năm tổng hợp báo cáo quyết toán các nguồn thu và các khoản chi với Bộ Quốc phòng và Bộ Tài chính.