Điều 5. Tổ chức của Cảng vụ hàng hải
1. Cơ cấu tổ chức của Cảng vụ hàng hải gồm có:
a) Phòng Pháp chế;
b) Phòng An toàn và Thanh tra hàng hải;
c) Phòng Tổ chức - Hành chính;
d) Phòng Tài vụ;
đ) Phòng Đăng ký tầu biển và thuyền viên, Đại diện Cảng vụ hàng hải (nếu có)
2. Cục trưởng Cục Hàng hải Việt Nam căn cứ quy định tại Khoản 1 Điều này và yêu cầu thực tế để quy định bộ máy tổ chức các phòng, đại diện từng Cảng vụ hàng hải. Giám đốc Cảng vụ hàng hải quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn của các phòng và đại diện sau khi được sự đồng ý của Cục trưởng Cục Hàng hải Việt Nam.
3. Cảng vụ hàng hải do Giám đốc lãnh đạo, có một số Phó Giám đốc giúp việc. Giám đốc do Cục trưởng Cục Hàng hải Việt Nam bổ nhiệm, miễn nhiệm. Phó Giám đốc do Cục trưởng Cục Hàng hải Việt Nam bổ nhiệm, miễn nhiệm theo đề nghị của Giám đốc. Kế toán trưởng, Trưởng Đại diện Cảng vụ hàng hải do Cục trưởng Cục Hàng Hải Việt Nam bổ nhiệm, miễn nhiệm theo đề nghị của Giám đốc. Trưởng phòng, Phó phòng nghiệp vụ khác do Giám đốc bổ nhiệm, miễn nhiệm.