Điều 12: Việc thanh lý, tiêu huỷ, giải mật các tài liệu, vật, mẫu vật... thuộc danh mục bí mật Nhà nước của Thành phố phải do Hội đồng thanh lý, tiêu huỷ tài liệu bí mật nhà nước kiểm tra xem xét thực tế và thẩm định trước khi trình Chủ tịch UBND Thành phố phê duyệt.
Hội đồng Thanh lý, tiêu hủy tài liệu bí mật Nhà nước gồm: Một đồng chí lãnh đạo UBND Thành phố, người đứng đầu cơ quan, ngành, đoàn thể quản lý bí mật nhà nước, người trực tiếp quản lý các bí mật được thanh lý hoặc tiêu huỷ và cán bộ bảo mật thực hiện. Quá trình thanh lý, tiêu hủy phải lập biên bản thống kê các nội dung có ghi rõ phương thức, phương tiện, người thực hiện và phải đảm bảo yêu cầu không làm lộ, lọt bí mật Nhà nước. Trường hợp thanh lý phương tiện hoặc mẫu vật, phải đáp ứng được yêu cầu làm thay đổi hình dạng, tính năng tác dụng của vật, mẫu vật...hoặc phải đốt, xé, nghiền nhỏ tới mức không thể phục hồi được.
Biên bản thanh lý, tiêu huỷ, tài liệu, vật thuộc Danh mục bí mật Nhà nước phải được lưu tại bộ phận bảo mật. Trường hợp không có điều kiện tổ chức tiêu huỷ theo quy định trên mà sự tồn tại của bí mật Nhà nưóc sẽ gây hậu quả nghiêm trọng cho an ninh quốc gia hoặc các lợi ích khác của đất nước thì người nắm giữ bí mật đó được quyền tiêu huỷ nhưng phải báo cáo bằng văn bản với người đứng đầu cơ quan, đơn vị và cơ quan công an có trách nhiệm cùng cấp ngay sau khi tiêu huỷ và chịu trách nhiệm trước pháp luật nếu việc tiêu huỷ không có lý do chính đáng.