Điều 2. Nhiệm vụ, quyền hạn:
1. Tham mưu cho Lãnh đạo Bộ, chỉ đạo tổ chức tuyên truyền giáo dục quốc phòng toàn dân và thực hiện công tác giáo dục quốc phòng toàn dân cho cán bộ, công chức, viên chức, người lao động trong các cơ quan đơn vị trực thuộc Bộ Y tế; phối hợp với Bộ Quốc phòng thực hiện bồi dưỡng kiến thức quốc phòng cho các đối tượng cán bộ, công chức, viên chức theo quy định của pháp luật.
2. Tham mưu cho Lãnh đạo Bộ xây dựng kế hoạch động viên thời chiến;giao chỉ tiêu kế hoạch xây dựng lực lượng dự bị động viên và huy động các nguồn lực của ngành Y tế để sẵn sàng đáp ứng yêu cầu bảo vệ Tổ quốc trong mọi tình huống. Tổ chức xây dựng, quản lý, huy động lực lượng dự bị động viên của ngành y tế; xây dựng kế hoạch đào tạo sỹ quan dự bị trong các trường đại học y, dược; quản lý đội ngũ sỹ quan dự bị quân y, quân dược tại các cơ quan đơn vị trực thuộc Bộ Y tế;
3. Tham mưu cho Lãnh đạo Bộ, chỉ đạo các cơ quan, đơn vị trực thuộc Bộ Y tế phối hợp chặt chẽ với cơ quan quân sự địa phương thực hiện công tác tổ chức, huấn luyện, hoạt động của lực lượng tự vệ; tổ chức theo dõi , đôn đốc giám sát việc thực hiện Luật nghĩa vụ quân sự trong ngành y tế.
4. Phối hợp với Bộ Quốc phòng và các địa phương xây dựng nền quốc phòng toàn dân, thế trận quốc phòng toàn dân, xây dựng cơ quan đơn vị vững mạnh toàn diện góp phần xây dựng khu vực phòng thủ vững chắc tại địa phương.
5. Tham gia xây dựng, góp ý các văn bản quy phạm pháp luật liên quan đến y tế quốc phòng, tham mưu cho Lãnh đạo Bộ về thực hiện các quy định của Nhà nước về bảo đảm ngân sách đối với sự nghiệp quốc phòng, xây dựng lực lượng vũ trang; thực hiện chính sách hậu phương quân đội và các chính sách khác có liên quan đến công tác quốc phòng.
6. Phối hợp với các cơ quan chức năng của Bộ Quốc phòng, hằng năm và từng thời kỳ tiến hành công tác kiểm tra, sơ kết, việc thực hiện nhiệm vụ quốc phòng và chương trình kết hợp quân dân y của Bộ Y tế
7. Thường trực Ban Điều hành Chương trình kết hợp quân dân y, giúp Ban Điều hành Chương trình triển khai các nội dung hoạt động của Chương trình theo kế hoạch đã được Lãnh đạo Bộ phê duyệt.
8. Thực hiện các nhiệm vụ khác do Lãnh đạo Bộ và lãnh đạo vụ Kế hoạch - Tài chính giao.