Điều 12. Trung tâm chịu sự quản lý trực tiếp và toàn diện của Giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư.
Giám đốc Trung tâm có trách nhiệm báo cáo Giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư chương trình, kế hoạch công tác hàng năm, quý, tháng và kết quả thực hiện chương trình, kế hoạch công tác để theo dõi, chỉ đạo.
Quan hệ làm việc giữa Trung tâm với các phòng chuyên môn, đơn vị trực thuộc Sở Kế hoạch và Đầu tư là quan hệ phối hợp theo chức năng, nhiệm vụ được phân công và theo quy chế làm việc của Sở Kế hoạch và Đầu tư.