Điều 9. Quy trình này chỉ được áp dụng khi hệ thống kiểm soát thu phí tự động đã được lắp đặt hoàn chỉnh theo yêu cầu của dự án đầu tư đã được phê duyệt. Trong quá trình áp dụng hệ thống kiểm soát thu phí tự động, nếu gặp trở ngại thì các đơn vị có trách nhiệm thu phí thực hiện thu phí theo hình thức thu phí thủ công nhưng phải đảm bảo thu đúng, thu đủ và đảm bảo các phương tiện vận tải ra vào các cửa khẩu được vận hành thông suốt.
Quy trình này được niêm yết công khai tại nơi thu phí và trên hệ thống thông tin điện tử tại địa chỉ: http://thuphichalo.vn. Trong quá trình tổ chức thực hiện, nếu phát sinh các khó khăn, vướng mắc, các cơ quan, đơn vị phản ánh kịp thời về Cục Thuế để tổng hợp, báo cáo UBND tỉnh điều chỉnh, bổ sung cho phù hợp tình hình thực tế, nhằm tổ chức quản lý thu phí có hiệu quả.