Điều 2. Thông tư này có hiệu lực kể từ ngày 1 tháng 10 năm 2013.
Trong trường hợp Quy chuẩn kỹ thuật Quốc gia tương ứng được ban hành thì mức giới hạn tối đa dư lượng thuốc thú y trong thực phẩm được thực hiện theo Quy chuẩn kỹ thuật đó. Bãi bỏ Phần 2 "Giới hạn tối đa dư lượng thuốc thú y trong thực phẩm" ban hành kèm theo Quyết định số 46/2007/QĐ-BYT ngày 19 tháng 12 năm 2007 của Bộ trưởng Bộ Y tế về "Quy định giới hạn tối đa ô nhiễm sinh học và hoá học trong thực phẩm" kể từ ngày Thông tư này có hiệu lực.