Hàng năm, Hội đồng quản trị hợp tác xã tổ chức tự đánh giá và cho điểm hợp tác xã mình theo các tiêu chí quy định tại Phụ lục 1 của Thông tư này. Ban Kiểm soát (hoặc kiểm soát viên) kiểm tra kết quả việc tự đánh giá theo mẫu hướng dẫn tại Phụ lục 2.
Căn cứ trên kết quả tự đánh giá đã được Hội đồng quản trị và ban kiểm soát (kiểm soát viên) thống nhất, hợp tác xã được xếp loại như sau:
Tốt: Tổng điểm đánh giá đạt từ 80 điểm đến 100 điểm;
Khá: Tổng điểm đánh giá đạt từ 65 điểm đến dưới 80 điểm;
Trung bình: Tổng điểm đánh giá đạt từ 50 điểm đến dưới 65 điểm;
Yếu: Tổng điểm đánh giá đạt dưới 50 điểm;
Trường hợp hợp tác xã mới thành lập và hoạt động chưa đủ 12 tháng hoặc hợp tác xã ngừng hoạt động từ trên 3 tháng trong năm thì không tiến hành đánh giá và xếp loại.