Điều 11. Giám đốc Qũy là người đại diện theo pháp luật của Qũy, được Chủ tịch Hội nước sạch - vệ sinh môi trường Việt Nam bổ nhiệm theo Nghị quyết ban thường vụ Hội. Giám đốc Qũy có nhiệm vụ và quyền hạn sau:
1. Chịu trách nhiệm quản lý, phát triển nguồn vốn và tài sản của Qũy theo Điều lệ và các quy định của pháp luật.
2. Tổ chức điều hành, quản lý hoạt động của Quy nhằm thực hiện các Nghị quyết của Hội đồng Bảo trợ và Quản lý Qũy.
3. Ký văn bản thuộc thẩm quyền và chịu trách về quyết định của mình.
4. Báo cáo định kỳ 6 tháng, hàng năm về tình hình hoạt động của Qũy với Hội đồng Bảo trợ và Quản lý Qũy, Ban thường vụ Hội và cơ quan nhà nước có thẩm quyền.
5. Chịu trách nhiệm trước Chủ tịch Hội nước sạch - Vệ sinh môi trường Việt Nam, Hội đồng Bảo trợ và Quản lý Qũy và trước pháp luật về toàn bộ kết qủa hoạt động của Qũy.
Giúp Giám đốc Qũy có Phó Giám đốc, Kế toán trưởng, văn phòng và các ban chuyên môn. Các phó Giám đốc , Kế toán trưởng và trưởng các ban chuyên môn của Qũy do Chủ tịch Hội đồng bảo trợ và quản lý quyết định và bổ nhiệm theo đề nghị của giám đốc.