Điều 6. Trách nhiệm của từng Ban, đơn vị trong việc xử lý các vấn đề liên quan đến KTNN như sau:
a) Ban Kê khai và Kế toán thuế: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến đăng ký, kê khai, tính thuế, nộp thuế, miễn thuế, giảm thuế, hoàn thuế, kế toán thuế, thống kê thuế.
b) Ban Dự toán thu thuế: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến công tác xây dựng, giao dự toán các khoản thu nội địa do ngành thuế quản lý.
c) Ban Quản lý nợ và cưỡng chế thuế: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến số nợ đọng thuế và cưỡng chế nợ thuế; xóa nợ tiền thuế và tiền phạt.
d) Ban Tài vụ quản trị: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến công tác quản lý tài chính, tài sản và đầu tư xây dựng cơ bản, công tác quản trị, quản lý ấn chỉ của ngành thuế.
e) Ban Quản lý Thuế thu nhập cá nhân: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến công tác quản lý thuế thu nhập cá nhân.
f) Ban Chính sách thuế: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến các văn bản quy phạm pháp luật và các văn bản hướng dẫn của Tổng cục Thuế hoặc do Tổng cục Thuế dự thảo trình Bộ Tài chính ban hành về chính sách thuế, quản lý thuế, chế độ quản lý sử dụng hóa đơn, chứng từ; các cơ chế tài chính liên quan đến thu NSNN.
g) Ban Thanh tra: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến các khoản truy thu, gian lận thuế, các khoản tạm thu tạm giữ của cơ quan thuế...
h) Ban Kiểm tra nội bộ: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến việc tuân thủ pháp luật, chấp hành công vụ, xử lý các vi phạm pháp luật của cơ quan thuế, cán bộ, công chức thuế.
i) Ban Hợp tác quốc tế: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến nhiệm vụ hợp tác quốc tế về thuế (trừ các dự án hỗ trợ cải cách và hiện đại hóa ngành thuế), đàm phán và tổ chức thực hiện các điều ước quốc tế về thuế.
j) Tạp chí thuế: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến hoạt động tổ chức phát hành Tạp chí thuế, phát hành văn bản pháp luật thuế, mẫu biểu sổ sách kế toán và hoạt động quảng cáo trên Tạp chí thuế…
k) Trường nghiệp vụ thuế: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến thực hiện kế hoạch đào tạo, bồi dưỡng chuyên môn, nghiệp vụ cho cán bộ công chức trong ngành thuế và đào tạo bồi dưỡng các kiến thức liên quan đến pháp luật thuế cho người nộp thuế.
l) Cục Ứng dụng công nghệ thông tin: Xử lý các nhận định, kiến nghị của KTNN liên quan đến triển khai ứng dụng công nghệ thông tin, hiện đại hóa công tác quản lý thuế.
m) Ban Pháp chế: Thẩm định tham gia ý kiến đối với dự thảo văn bản giải trình các nhận định, kiến nghị của cơ quan KTNN, dự thảo văn bản hướng dẫn chính sách, chế độ về thuế, quản lý thu thuế của các Ban, đảm bảo tính pháp lý và phù hợp của văn bản.
n) Ban Tổ chức cán bộ: Thẩm định, đề xuất, kiến nghị lãnh đạo Tổng cục Thuế xem xét xử lý đối với cán bộ, công chức thuế vi phạm pháp luật, vi phạm các quy định, quy trình quản lý thuế mà cơ quan kiểm toán đã phát hiện và kiến nghị.
o) Ban Tuyên truyền - Thi đua: Căn cứ vào các kết luận, kiến nghị tại các Báo cáo kiểm toán chính thức để trình lãnh đạo Tổng cục không xem xét các hình thức khen thưởng đối với các Cục Thuế, các cán bộ công chức thuế vi phạm pháp luật, vi phạm các quy định, quy trình quản lý thuế mà cơ quan kiểm toán đã phát hiện và kiến nghị.
Đối với các Ban, đơn vị khác có liên quan: Trên cơ sở các nhận định, kiến nghị trong Báo cáo kiểm toán của cơ quan KTNN, lãnh đạo Tổng cục Thuế sẽ phân công nhiệm vụ cụ thể.