Điều 3. Cơ cấu tổ chức của Trung tâm:
3.1. Lãnh đạo Trung tâm gồm có Giám đốc và các Phó giám đốc giúp việc cho Giám đốc
3.2. Cán bộ của Trung tâm là do Viện Khoa học Thuỷ lợi điều động trong số cán bộ nằm trong biên chế hiện có của Viện (có thể bổ sung thêm biên chế theo yêu cầu nhiệm vụ).
Trung tâm có thể sử dụng cán bộ hợp đồng dài hạn và ngắn hạn để thực hiện nhiệm vụ,chi phí tiền lương và các chế độ khác Trung tâm tự giải quyết.