Điều 3. Tổ chức của Trung tâm:
*Lãnh đạo Trung tâm có: Giám đốc và các Phó giám đốc Trung tâm, do Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và phát triển nông thôn bổ nhiệm, miễn nhiệm theo quy định hiện hành,
*Các bộ phận chuyên môn,
*Đại diện phía Nam tại 135 Pasteur, quận 3, thành phố Hồ Chí Minh.
Giao cho Giám đốc Trung tâm quy định chức năng, nhiệm vụ, biên chế, quy chế hoạt động và tổ chức của các bộ phận chuyên môn theo các quy định và hướng dẫn của Bộ.