Điều 6. Quản lý dự án
1. Nội dung quản lý dự án bao gồm: hướng dẫn xây dựng dự án, thẩm định nội dung và xét duyệt, kiểm tra thực hiện, đánh giá kết quả, tổ chức nghiệm thu bàn giao,quyết toán dự án.
2. Phân công quản lý dự án:
a) Vụ Khoa học Công nghệ và CLSP giúp Bộ trưởng quản lý và tổng hợp các dự án sửdụng kinh phí từ nguồn vốn sự nghiệp khoa học công nghệ và các dự án có nội dung liên quan đến nghiên cứu khoa học, chuyển giao công nghệ, môi trường và tăng cường tiềm lực khoa học công nghệ.
b) Vụ Kế hoạch và Qui hoạch giúp Bộ trưởng quản lý các dự án sử dụng kinh phí từng nguồn vốn sự nghiệp kinh tế và các dự án có nội dung liên quan đến điều tra cơ bản, đầu tư phát triển, qui hoạch và chịu trách nhiệm tổng hợp chung tất cả cácdự án để báo cáo Bộ.
c) Vụ Đầu tư Xây dựng Cơ bản giúp Bộ trưởng quản lý và tổng hợp các dự án sử dụng kinh phí từ nguồn vốn đầu tư xây dựng cơ bản.
d) Vụ Tổ chức Cán bộ giúp Bộ trưởng quản lý và tổng hợp các dự án sử dụng kinh phítừ nguồn vốn sự nghiệp đào tạo và các dự án có nội dung liên quan đến đào tạo nguồn nhân lực, tổ chức bộ máy, cải cách hành chính.
e) Vụ Tài chính Kế toán giúp Bộ trưởng quản lý các vấn đề về tài chính-kế toán của tất cả các dự án; hướng dẫn các đơn vị thực hiện thu chi theo đúng chế độ hiện hành của Nhà nước đồng thời đề xuất bổ sung hoặc sửa đổi các qui chế và định mức chi tiêu không còn phù hợp nhằm tạo điều kiện cho các đơn vị thực hiện dự án được thuận lợi và hiệu quả.
g) Thanh tra bộ giúp Bộ trưởng về công tác thanh tra, kiểm tra các công trình, dự án theo đúng chức năng quản lý Nhà nước của Bộ và các quy định của pháp luật thanh tra, kiểm tra.
h) Các Cục chức năng: Phát triển Lâm nghiệp, Khuyến nông Khuyến lâm, Định canh định cư và Vùng kinh tế mới, Quản lý nước và Công trình thuỷ lợi, Phòng chống lụt bão và Quản lý đê điều, Bảo vệ Thực vật, Thú y,... quản lý các dự án thuộc phạm vi của đơn vị theo phân công của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn và gửi báo cáo định kỳ cho Vụ Kế hoạch -Quy hoạch để tổng hợp.