Điều 3. Đài Khí tượng thuỷ văn khu vực Tây nguyên có một Giám đốc phụ trách và một số Phó Giám đốc giúp việc. Giám đốc và Phó giám đốc Đài do Tổng cục trưởng Tổng cục Khí tượng thuỷ văn bổ nhiệm, miễn nhiệm.
Cơ cấu tổ chức, nhiệm vụ cụ thể và biên chế của Đài do Tổng cục trưởng Tổng cục Khí tượng thuỷ văn quy định sau khi có sự thoả thuận của Bộ trưởng, Trưởng ban Ban Tổ chức - Cán bộ Chính phủ.