Điều 4. Ban quản lý khu công nghiệp Dung Quất có tư cách pháp nhân, có tài khoản, có con dấu riêng, có biên chế chuyên trách và kinh phí hoạt động do ngân sách Nhà nước cấp; trụ sở Ban quản lý đặt tại tỉnh Quảng Ngãi.
Ban quản lý có Trưởng ban, một số Phó trưởng ban và bộ máy giúp việc. Trong số Phó Trưởng ban có một Phó Chủ tịch Uỷ ban nhân dân tỉnh đại diện Uỷ ban nhân tỉnh Quảng Ngãi, một Phó Chủ tịch Uỷ ban nhân dân tỉnh đại diện của Uỷ ban nhân dân tỉnh Quảng Nam - Đà Nẵng, một đại diện Bộ Quốc phòng, các đại diện này làm việc kiêm nhiệm.
Bộ trưởng, Trưởng ban Tổ chức - Cán bộ Chính phủ trình Thủ tướng Chính phủ bổ nhiệm Trưởng ban và các Phó trưởng ban.
Bộ máy giúp việc của Ban quản lý do Trưởng ban quyết định sau khi có sự chấp thuận của Ban Tổ chức - Cán bộ Chỉnh phủ.