Điều 5. Tính thuế trị giá gia tăng phải nộp được áp dụng một trong hai phương pháp sau đây:
1- Phương pháp khấu trừ số thuế trị giá gia tăng đã nộp ở khâu trước (gọi tắt là phương pháp khấu trừ): Số thuế trị giá gia tăng phải nộp là chênh lệch giữa số thuế trị giá gia tăng tính trên toàn bộ doanh thu chịu thuế và số thuế thuế trị giá gia tăng đã nộp ở khâu trước; công thức tính.
2- Phương pháp tính thuế trên chênh lệch (gọi tắt là phương pháp chênh lệch): số thuế trị giá gia tăng phải nộp được tính trên chênh lệch giữa doanh thu chịu thuế và giá trị vật tư hàng hoá mua vào ứng với doanh thu chịu thuế;
Công thức tính:
Phương pháp tính thuế trên chênh lệch chỉ áp dụng cho các ngành kinh doanh thương nghiệp, tín dụng ngân hàng, kinh doanh vàng, bạc. .. với các thuế suất đã được quy định trong Luật thuế doanh thu.