Điều 10. Cơ cấu tổ chức của bệnh viện
a. Các phòng chức năng: 08 phòng
1. Phòng Kế hoạch Tổng hợp
2. Phòng Tổ chức cán bộ
3. Phòng Đào tạo, Quản lý Nghiên cứu khoa học
4. Phòng Điều dưỡng
5. Phòng Tài chính - Kế toán
6. Phòng Chỉ đạo tuyến
7. Phòng Vật tư - Thiết bị y tế
8. Phòng Hành chính Quản trị
b. Các khoa lâm sàng: 21 khoa
1. Khoa Khám bệnh Tâm thần
2. Khoa Khám bệnh Nội Thần kinh chức năng
3. Khoa Động kinh Nam
4. Khoa Động kinh Nữ
5. Khoa Động kinh Nam I
6. Khoa Động kinh Nam II
7. Khoa Động kinh Nữ I
8. Khoa Động kinh Nữ II
9. Khoa Tâm thần người cao tuổi
10. Khoa Tâm thần trẻ em
11. Khoa Tâm thần Cán bộ và Quốc tế
12. Khoa Tâm thần do nghiện các chất
13. Khoa Tâm thần Lao - HIV/AIDS
14. Khoa Tâm thần Truyền nhiễm
15. Khoa Tâm thần Pháp y
16. Khoa Phục hồi chức năng
17. Khoa Tâm lý lâm sàng
18. Khoa Bệnh chức năng Thần kinh
19. Khoa Hồi sức Cấp cứu
20. Khoa Y học Cổ truyền
21. Khoa Điều trị Tự nguyện
Các khoa Cận lâm sàng: 05 khoa
1. Khoa Xét nghiệm
2. Khoa Chẩn đoán hình ảnh và Thăm dò chức năng
3. Khoa Dược
4. Khoa Chống nhiễm khuẩn
5. Khoa Dinh dưỡng
Các Khoa, phòng khác: Sẽ được Bộ trưởng Bộ Y tế quyết định thành lập khicó nhu cầu theo đề nghị của Giám đốc bệnh viện.