Điều 3. Cơ cấu tổ chức
1. Lãnh đạo Cảng vụ: gồm Giám đốc và 02 Phó Giám đốc
a) Giám đốc là người đứng đầu Cảng vụ, do Giám đốc Sở bổ nhiệm, miễn nhiệm, có nhiệm vụ lãnh chỉ đạo chung mọi hoạt động của đơn vị, chịu trách nhiệm trước Giám đốc Sở và trước pháp luật về toàn bộ hoạt động của Cảng vụ đường thủy nội địa theo quy định;
b) Phó Giám đốc Cảng vụ do Giám đốc Sở bổ nhiệm, là người giúp Giám đốc Cảng vụ thực hiện một số lĩnh vực công tác cụ thể được Giám đốc Cảng vụ giao và chịu trách nhiệm trước Giám đốc Cảng vụ và trước pháp luật về các nhiệm vụ được phân công. Khi Giám đốc Cảng vụ vắng mặt, 01 Phó Giám đốc được Giám đốc ủy nhiệm điều hành các hoạt động của đơn vị theo quy định.
2. Tổ chức chuyên môn, nghiệp vụ
a) Phòng Tổ chức - Hành chính - Tài chính;
b) Phòng An toàn - Quản lý kết cấu hạ tầng.