Điều 4. Nguyên tắc thanh toán, quyết toán vốn lồng ghép
1. Căn cứ quyết định phê duyệt dự án, quyết định phân bổ dự toán thực hiện các dự án, hoạt động, nội dung thuộc các Chương trình mục tiêu quốc gia và các chương trình lồng ghép khác; đơn vị thực hiện phải xác định cụ thể từng nguồn vốn lồng ghép để thực hiện đối với từng dự án, hoạt động, nội dung có cùng mục tiêu và cùng một địa bàn; mở sổ theo dõi riêng từng nguồn vốn tương ứng với từng dự án, hoạt động, nội dung thuộc Chương trình mục tiêu quốc gia.
2. Cơ quan tài chính các cấp, Kho bạc Nhà nước nhập dự toán theo phân cấp ngân sách; Kho bạc Nhà nước thực hiện kiểm soát chi vốn đầu tư, vốn sự nghiệp đảm bảo đúng theo mã của từng chương trình, dự án, mã nguồn ngân sách các cấp.
3. Đơn vị, chủ đầu tư thực hiện tạm ứng vốn theo quy định, trong đó phải xác định mức vốn tạm ứng cụ thể của từng nguồn vốn, chi tiết theo từng mã chương trình, dự án, mã nguồn ngân sách.
4. Căn cứ khối lượng công việc hoàn thành, các đơn vị thực hiện lập hồ sơ thanh toán theo quy định; trong đó xác định khối lượng công việc hoàn thành của từng nguồn vốn và lập thủ tục thanh toán tương ứng đối với từng nguồn vốn. Trường hợp trong một bộ hồ sơ thanh toán, quyết toán từ nhiều nguồn vốn, đơn vị phải thuyết minh rõ trong hồ sơ theo từng nội dung, số đã chi thuộc chương trình, dự án, hoạt động cụ thể theo từng nguồn vốn; đồng thời, đơn vị mở sổ theo dõi riêng số quyết toán của từng nguồn vốn tương ứng với từng phần việc trong dự án, công trình, hoạt động thuộc Chương trình mục tiêu quốc gia.
5. Sau khi hoàn thành dự án, hoạt động, nội dung thuộc Chương trình mục tiêu quốc gia, nếu nguồn vốn còn dư so với dự toán được giao thì khi xác định số quyết toán, ưu tiên sử dụng hết nguồn huy động, đóng góp, phần còn thiếu được sử dụng nguồn ngân sách nhà nước theo quy định và các nguồn khác (nếu có).
6. Trong báo cáo quyết toán, các cơ quan, đơn vị, địa phương phải có báo cáo thuyết minh quyết toán cụ thể đối với từng nguồn vốn trong một dự án, hoạt động, nội dung thuộc Chương trình mục tiêu quốc gia.