Điều 3. Cơ cấu tổ chức và hoạt động
1. Lãnh đạo Thanh tra Bộ: có Chánh Thanh tra Bộ, các Phó Chánh Thanh tra Bộ.
Chánh Thanh tra Bộ do Bộ trưởng Bộ Y tế bổ nhiệm, miễn nhiệm sau khi thống nhất với Tổng Thanh tra; chịu trách nhiệm trực tiếp trước Bộ trưởng Bộ Y tế và trước pháp luật, đồng thời chịu trách nhiệm trước Tổng Thanh tra về các hoạt động của Thanh tra Bộ trong việc thực hiện chức năng, nhiệm vụ được giao.
Các Phó Chánh Thanh tra Bộ do Bộ trưởng Bộ Y tế bổ nhiệm, miễn nhiệm theo đề nghị của Chánh Thanh tra Bộ; Phó Chánh Thanh tra Bộ giúp Chánh Thanh tra Bộ, được Chánh Thanh tra Bộ phân công phụ trách các lĩnh vực cụ thể; chịu trách nhiệm trước Bộ trưởng Bộ Y tế, Chánh Thanh tra Bộ và trước pháp luật về thực hiện nhiệm vụ được phân công.
2. Tổ chức bộ máy của Thanh tra Bộ:
a) Phòng Thanh tra y tế dự phòng;
b) Phòng Thanh tra Khám, chữa bệnh;
c) Phòng Thanh tra Dược, Mỹ phẩm, Trang thiết bị y tế
d) Phòng Thanh tra hành chính và phòng, chống tham nhũng;
e) Phòng Tổng hợp;
g) Phòng Đại diện Thanh tra Bộ tại phía Nam (nằm trong Cơ quan đại diện của Bộ Y tế tại thành phố Hồ Chí Minh).
3. Cơ chế hoạt động
a) Thanh tra Bộ hoạt động theo chế độ Thủ trưởng;
b) Chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn, mối quan hệ của các Phòng thuộc Thanh tra Bộ do Chánh Thanh tra Bộ quy định trên cơ sở chức năng, nhiệm vụ của Thanh tra Bộ Y tế được Bộ trưởng Bộ Y tế giao.
c) Trưởng phòng, phó Trưởng phòng của các phòng thuộc Thanh tra Bộ được bổ nhiệm, miễn nhiệm theo các quy định của pháp luật hiện hành.
d) Thanh tra viên, công chức của Thanh tra Bộ chịu trách nhiệm trước Chánh Thanh tra Bộ và trước pháp luật về việc thi hành nhiệm vụ được giao; có nghĩa vụ và quyền lợi theo quy định của pháp luật.
đ) Các chức danh Chánh Thanh tra Bộ, Phó Chánh Thanh tra Bộ, lãnh đạo các Phòng thuộc Thanh tra Bộ được hưởng phụ cấp theo quy định hiện hành.
4. Biên chế.
Biên chế của Thanh tra Bộ được xác định theo Quyết định của Bộ trưởng Bộ Y tế và được điều chỉnh hàng năm theo nhu cầu công tác trên cơ sở đề xuất của Chánh Thanh tra Bộ.