Điều 5. Cơ cấu tổ chức chi nhánh Ngân hàng Nhà nước gồm có:
1. Thanh tra Ngân hàng;
2. Phòng Tổng hợp và quản lý các tổ chức tín dụng;
3. Phòng tiền tệ - kho quỹ;
4. Phòng Kế toán và thanh toán;
5. Phòng hành chính - nhân sự;
6. Bộ phận kiểm soát.
Riêng chi nhánh Ngân hàng Nhà nước Hà Nội, Thành phố Hồ Chí Minh và các Chi nhánh có quy mô lớn được Ngân hàng Trung ương cho phép thành lập thêm một số Phòng cần thiết.
Trong cơ cấu tổ chức, Phòng Kế toán và thanh toán có con dấu riêng dùng trong hoạt động nghiệp vụ theo quy định của Thống đốc.