Điều 5. Cơ cấu tổ chức
1. Lãnh đạo Trung tâm: gồm Giám đốc và không quá 02 Phó Giám đốc.
a) Giám đốc Trung tâm là người đứng đầu Trung tâm, phụ trách, điều hành chung hoạt động của Trung tâm, chịu trách nhiệm trước Giám đốc Sở Y tế và trước pháp luật về toàn bộ hoạt động và kết quả công tác của Trung tâm;
b) Phó Giám đốc Trung tâm giúp Giám đốc Trung tâm thực hiện một hoặc một số nhiệm vụ cụ thể do Giám đốc Trung tâm phân công và chịu trách nhiệm trước Giám đốc Trung tâm và trước pháp luật về thực hiện nhiệm vụ được phân công. Khi Giám đốc Trung tâm vắng mặt, một Phó Giám đốc Trung tâm được Giám đốc Trung tâm ủy nhiệm thay Giám đốc Trung tâm điều hành các hoạt động của Trung tâm;
c) Việc bổ nhiệm, bổ nhiệm lại, miễn nhiệm, luân chuyển, điều động, khen thưởng, kỷ luật, cho từ chức, nghỉ hưu và thực hiện các chế độ chính sách đối với Giám đốc Trung tâm và Phó Giám đốc Trung tâm theo quy định hiện hành và phân cấp quản lý cán bộ của tỉnh.
2. Các phòng chức năng:
a) Phòng Tổ chức - Hành chính;
b) Phòng Tài chính - Kế toán;
c) Phòng Kế hoạch - Nghiệp vụ - Điều dưỡng.
3. Các khoa chuyên môn (12 khoa)
a) Lĩnh vực y tế dự phòng, sức khỏe sinh sản, an toàn thực phẩm, dân số
- Khoa Y tế dự phòng.
b) Lĩnh vực khám bệnh, chữa bệnh, phục hồi chức năng, các dịch vụ y tế khác
+ Khoa Khám bệnh 1;
+ Khoa Nhi - Cấp cứu;
+ Khoa Nội - Y học cổ truyền - Phục hồi chức năng;
+ Khoa Ngoại - Sản - Liên chuyên khoa (Tại Mũi Họng - Răng Hàm Mặt - Mắt - Da liễu);
+ Khoa Truyền nhiễm - Methadone;
+ Khoa Dược - Cận lâm sàng 1.
- Các khoa đặt tại Trung tâm Y tế thành phố Hoa Lư - Cơ sở 2
+ Khoa Khám bệnh 2;
+ Khoa Nội - Cấp cứu - Y học cổ truyền - Phục hồi chức năng;
+ Khoa Sản - Liên chuyên khoa (Tại Mũi Họng - Răng Hàm Mặt);
+ Khoa Dược - Cận lâm sàng 2.
4. Các trạm y tế (20 trạm y tế)
Trạm Y tế phường Vân Giang;
Trạm Y tế phường Ninh Phúc;
Trạm Y tế xã Ninh Nhất;
Trạm Y tế phường Ninh Mỹ;
Trạm Y tế phường Ninh Giang;
Trạm Y tế xã Ninh Hải;
Trạm Y tế xã Trường Yên;
Trạm Y tế xã Ninh Hòa;
Trạm Y tế xã Ninh Khang;
Trạm Y tế xã Ninh An;
Trạm Y tế xã Ninh Vân;
Trạm Y tế phường Ninh Sơn;
Trạm Y tế phường Bích Đào;
Trạm Y tế phường Ninh Phong;
Trạm Y tế phường Nam Bình;
Trạm Y tế phường Nam Thành;
Trạm Y tế phường Đông Thành;
Trạm Y tế phường Ninh Khánh;
Trạm Y tế phường Tân Thành;
Trạm Y tế xã Ninh Tiến.