Điều 3. Tổ chức bộ máy và biên chế
1. Lãnh đạo Sở:
a) Sở Giao thông vận tải có Giám đốc và không quá 03 Phó Giám đốc;
b) Giám đốc Sở là người đứng đầu, chịu trách nhiệm trước Ủy ban nhân dân, Chủ tịch Ủy ban nhân dân tỉnh và trước pháp luật về toàn bộ hoạt động của Sở; chịu trách nhiệm báo cáo công tác trước Hội đồng nhân dân tỉnh và Bộ Giao thông vận tải theo quy định;
c) Phó Giám đốc Sở là người giúp Giám đốc, chịu trách nhiệm trước Giám đốc và trước pháp luật về các nhiệm vụ được phân công; khi Giám đốc vắng mặt, một Phó Giám đốc được Giám đốc ủy nhiệm điều hành các hoạt động của Sở;
2. Các tổ chức tham mưu và giúp Giám đốc Sở thực hiện chức năng quản lý nhà nước, gồm:
- Văn phòng Sở;
- Thanh tra Sở;
- Phòng Kế hoạch - Tài chính;
- Phòng Kỹ thuật và Chất lượng công trình;
- Phòng Giao thông và An toàn giao thông;
- Phòng Vận tải;
- Phòng Đăng kiểm.
3. Các đơn vị sự nghiệp thuộc Sở, gồm:
- Trung tâm tư vấn xây dựng giao thông Phú Thọ;
- Ban quản lý Bến xe khách tỉnh Phú Thọ;
- Trung tâm Đào tạo và Sát hạch lái xe Phú Thọ;
- Ban QLDA Giao thông Phú Thọ;
- Ban QLDA Giải phóng mặt bằng đường cao tốc Nội Bài - Lào Cai trên địa bàn tỉnh Phú Thọ.
- Ban quản lý bảo trì đường bộ.