Điều 3. Học viện Y - Dược học cổ truyền Việt Nam hoạt động theo Điều lệ trường đại học ban hành kèm theo Quyết định số 153/2003/QĐ-TTg ngày 30 tháng 07 năm 2003 của Thủ tướng Chính phủ.
Bộ trưởng Bộ Y tế quy định cụ thể về chức năng, nhiệm vụ, cơ chế làm việc và cơ cấu tổ chức của Học viện theo tinh thần phát huy tốt tiềm năng các cơ sở nghiên cứu và đào tạo về y dược học cổ truyền.