Điều 3. Cơ cấu tổ chức
a) Các tổ chức giúp việc Cục trưởng:
1. Ban Kế hoạch - Đầu tư;
2. Ban Khoa học - Công nghệ;
3. Ban Quản lý cảng hàng không, sân bay;
4. Ban Tiêu chuẩn an toàn bay;
5. Ban Vận tải hàng không;
6. Ban Quản lý hoạt động bay;
7. Ban An ninh hàng không;
8. Ban Tổ chức cán bộ;
9. Ban Tài chính;
10. Thanh tra Hàng không;
11. Văn phòng.
Việc thành lập các Phòng trực thuộc Ban do Bộ trưởng Bộ Giao thông vận tải quyết định theo đề nghị của Cục trưởng Cục Hàng không Việt Nam.
b) Các đơn vị trực thuộc Cục:
1. Trung tâm Quản lý bay dân dụng Việt Nam;
2. Cụm cảng Hàng không miền Bắc;
3. Cụm cảng Hàng không miền Trung;
4. Cụm cảng Hàng không miền Nam.
c) Các đơn vị sự nghiệp:
1. Trường Hàng không Việt Nam;
2. Trung tâm Y tế Hàng không;
3. Tạp chí Hàng không.