Điều 16. Đứng đầu Công ty là Giám đốc Công ty. Giám đốc là đại diện pháp nhân của Công ty, tổ chức điều hành mọi hoạt động của Công ty bằng Điều lệ, theo chế độ thủ trưởng và chịu trách nhiệm trước Viện trưởng Viện Năng lượng nguyên tử Việt Nam, Bộ trưởng Bộ Khoa học, Công nghệ và Môi trường và pháp luật về toàn bộ hoạt động của Công ty.
Để thực hiện chức trách trên, Giám đốc có nhiệm vụ và quyền hạn theo qui định của Luật doanh nghiệp Nhà nước.