Điều 5. Nguyên tắc hoạt động
1. Thanh tra Bộ hoạt động theo quy định của pháp luật về thanh tra và các quy định tại Quyết định này.
2. Bộ trưởng chỉ đạo hoạt động đối với Thanh tra Bộ chủ yếu thông qua Chánh thanh tra Bộ. Chánh thanh tra Bộ chịu trách nhiệm trước Bộ trưởng về việc thực hiện chức năng thanh tra và nhiệm vụ được phân công theo quy định của pháp luật.
3. Chánh thanh tra Bộ lãnh đạo, chỉ đạo công tác thanh tra theo chế độ phòng. Các Phó Chánh thanh tra Bộ giúp việc Chánh thanh tra Bộ, trực tiếp chỉ đạo và thực hiện một số nhiệm vụ theo phân công của Chánh thanh tra Bộ và chịu trách nhiệm trước Chánh Thanh tra Bộ về phần việc đó. Trưởng phòng tổ chức thực hiện và chịu trách nhiệm trước lãnh đạo Thanh tra Bộ về phần việc được phân công.
4. Công chức thuộc Thanh tra Bộ chịu sự quản lý, điều hành trực tiếp của Chánh thanh tra Bộ, Trưởng phòng và chịu sự chỉ đạo về chuyên môn nghiệp vụ của các Phó Chánh thanh tra Bộ, chịu trách nhiệm trước Chánh Thanh tra Bộ và Trưởng phòng về phần nhiệm vụ được giao. Trong trường hợp Bộ trưởng và các Thứ trưởng làm việc trực tiếp với Phó Chánh thanh tra Bộ, Trưởng phòng, Phó Trưởng phòng, Thanh tra viên và chuyên viên, thì Phó Chánh thanh tra bộ, Trưởng phòng, Phó Trưởng phòng, Thanh tra viên và chuyên viên có trách nhiệm thực hiện, sau đó báo cáo lại với Chánh Thanh tra Bộ.
5. Đoàn Thanh tra, Thanh tra viên trong Đoàn thực hiện nhiệm vụ theo Luật Thanh tra và Quy chế hoạt động của Đoàn Thanh tra do Thanh tra Chính phủ ban hành.
6. Thanh tra Bộ có trách nhiệm phối hợp với các tổ chức giúp việc Bộ trưởng, các tổ chức trong và ngoài ngành để thực hiện nhiệm vụ được giao.