Điều 2. Vườn quốc gia Núi Chúa tỉnh Ninh Thuận (sau đây gọi tắt là Vườn quốc gia) trực thuộc Ủy ban nhân dân tỉnh Ninh Thuận, chịu sự quản lý trực tiếp của Ủy ban nhân dân tỉnh đồng thời chịu sự quản lý về chuyên môn nghiệp vụ Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn.
Vườn quốc gia là đơn vị sự nghiệp có thu tự đảm bảo một phần kinh phí, có quyền tự chủ và tự chịu trách nhiệm theo quy định của pháp luật hiện hành; có tư cách pháp nhân; có con dấu và tài khoản riêng và có trụ sở làm việc đặt tại 2 địa điểm như sau:
1. Trụ sở chính đặt tại xã Vĩnh Hải, huyện Ninh Hải, tỉnh Ninh Thuận.
2. Văn phòng đại diện đặt tại thị trấn Khánh Hải, huyện Ninh Hải, tỉnh Ninh Thuận.