Điều 3. Cơ cấu tổ chức:
1. Tổ chức giúp Cục trưởng thực hiện chức năng quản lý Nhà nước:
a. Phòng Kế hoạch - Tài chính;
b. Phòng Cơ sở hạ tầng;
c. Phòng Vận tải - Pháp chế;
d. Phòng Thanh tra giao thông;
đ. Văn phòng.
2. Cục trưởng và các Phó Cục trưởng:
a. Cục trưởng Cục Đường sắt Việt Nam chịu trách nhiệm trước Bộ trưởng Bộ Giao thông vận tải thực hiện nhiệm vụ và quyền hạn quản lý Nhà nước chuyên ngành về giao thông vận tải đường sắt,
b. Cục trưởng Cục Đường sắt Việt Nam do Bộ trưởng Bộ Giao thông vận tải bổ nhiệm, miễn nhiệm với thời hạn 5 năm.
c. Các Phó Cục trưởng Cục Đường sắt Việt Nam do Bộ trưởng Bộ Giao thông vận tải bổ nhiệm, miễn nhiệm theo đề nghị của Cục trưởng với thời hạn 5 năm.