Điều 3. Cơ cấu tổ chức bộ máy
1. Lãnh đạo Sở
a) Sở Y tế có Giám đốc và không quá 03 Phó Giám đốc;
b) Giám đốc Sở là người đứng đầu Sở, chịu trách nhiệm trước UBND, Chủ tịch UBND tỉnh và trước pháp luật về toàn bộ hoạt động của Sở;
c) Phó Giám đốc Sở là người giúp Giám đốc Sở, chịu trách nhiệm trước Giám đốc Sở và trước pháp luật về các nhiệm vụ được phân công; khi Giám đốc Sở vắng mặt, một Phó Giám đốc được Giám đốc ủy nhiệm điều hành các hoạt động của Sở;
d) Việc bổ nhiệm, miễn nhiệm, cách chức đối với Giám đốc, Phó Giám đốc Sở do Chủ tịch UBND tỉnh quyết định theo tiêu chuẩn chuyên môn, nghiệp vụ do Bộ Y tế ban hành và theo quy định của pháp luật.
2. Cơ cấu tổ chức thuộc Sở, gồm có:
2.1. Các phòng chuyên môn, nghiệp vụ
a) Phòng Tổ chức- Hành chính- Tổng hợp;
b) Thanh tra;
c) Phòng Kế hoạch- Thống kê;
d) Phòng Tài chính- Kế toán;
e) Phòng Nghiệp vụ y;
g) Phòng Nghiệp vụ dược.
2.2. Chi cục trực thuộc Sở: Chi cục Dân số- Kế hoạch hóa gia đình
2.3. Các đơn vị sự nghiệp trực thuộc Sở
Tuyến tỉnh gồm có 15 đơn vị.
1. Trung tâm Y tế dự phòng
2. Trung tâm Phòng chống HIV/AIDS
3. Trung tâm Kiểm dịch Y tế quốc tế
4. Trung tâm Chăm sóc sức khỏe sinh sản
5. Trung tâm Kiểm nghiệm Thuốc- Mỹ phẩm- Thực phẩm
6. Trung tâm Truyền thông giáo dục sức khỏe
7. Trung tâm Phòng, chống bệnh xã hội
8. Trung tâm Giám định Y khoa
9. Trung tâm Pháp y
10. Bệnh viện đa khoa tỉnh
11. Bệnh viện đa khoa khu vực Triệu Hải
12. Bệnh viện điều dưỡng và phục hồi chức năng Cửa Tùng
13 . Phòng Quản lý sức khỏe cán bộ
14. Trường Trung học Y tế
15. Bệnh viện y dược cổ truyền (Có Quyết định thành lập riêng)
Tuyến huyện gồm có 17 đơn vị:
1. Trung tâm Y tế dự phòng Vĩnh Linh
2. Trung tâm Y tế dự phòng Gio Linh
3. Trung tâm Y tế dự phòng Cam Lộ
4. Trung tâm Y tế dự phòng Đakrông
5. Trung tâm Y tế dự phòng Hướng Hóa
6. Trung tâm Y tế dự phòng Hải Lăng
7. Trung tâm Y tế dự phòng Triệu Phong
8. Trung tâm Y tế dự phòng thị xã Đông Hà
9 . Trung tâm Y tế ở thị xã Quảng Trị
10. Bệnh viện đa khoa huyện Vĩnh Linh
11. Bệnh viện đa khoa huyện Triệu Phong
12. Bệnh viện đa khoa huyện Gio Linh
13. Bệnh viện đa khoa huyện Cam Lộ
14. Bệnh viện đa khoa huyện Đakrông
15. Bệnh viện đa khoa huyện Hướng Hóa
16. Bệnh viện đa khoa huyện Hải Lăng
17. Bệnh viện đa khoa thị xã Đông Hà.
Chi cục và các đơn vị sự nghiệp trực thuộc Sở Y tế có tư cách pháp nhân, có con dấu và tài khoản riêng.