Điều 4. Vụ Hợp tác quốc tế có một Vụ trưởng và một số Phó Vụ trưởng.
Vụ trưởng có trách nhiệm quản lý toàn diện công chức của Vụ theo qui định của Bộ; tổ chức học tập và bồi dưỡng nâng cao trình độ cho công chức; chịu trách nhiệm trước Bộ trưởng Bộ Tài chính về toàn bộ hoạt động của Vụ.
Phó Vụ trưởng chịu trách nhiệm trước Vụ trưởng về nhiệm vụ được phân công.
Vụ Hợp tác quốc tế có các phòng:
1. Phòng ASEAN
2. Phòng WTO
3. Phòng Chương trình - Dự án.
4. Phòng Đối ngoại.
Nhiệm vụ cụ thể của từng Phòng do Vụ trưởng Vụ Hợp tác quốc tế quy định.
Vụ Hợp tác quốc tế tổ chức làm việc theo chế độ chuyên viên kết hợp với tổ chức phòng.
Đối với những công việc thực hiện theo chế độ chuyên viên, Vụ trưởng Vụ Hợp tác quốc tế có trách nhiệm tổ chức công việc, phân công nhiệm vụ cho từng công chức phù hợp với chức danh tiêu chuẩn, năng lực và chuyên môn được đào tạo để hoàn thành nhiệm vụ được giao.
Biên chế của Vụ Hợp tác quốc tế do Bộ trưởng Bộ Tài chính quy định.