Điều 6. Không thực hiện khoán kinh phí hoạt động đối với các khoản chi sau đây:
1. Chi xây dựng cơ bản tập trung do ngân sách nhà nước cấp;
2. Chi thực hiện dự án tin học hoá quy trình nghiệp vụ hải quan theo chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ tại công văn số 805/CP-KG ngày 15 tháng 7 năm 2002;
3. Chi dự án đầu tư trang thiết bị chuyên dùng phòng, chống ma túy, dự án trang bị máy soi đã được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt.
4. Chi hiện đại hóa tin học theo chương trình của Chính phủ.
5. Chi đào tạo, bồi dưỡng cán bộ, công chức theo kế hoạch của Nhà nước.
6. Chi thực hiện các đề tài nghiên cứu khoa học cấp Nhà nước, cấp Bộ.
7. Chi các chương trình mục tiêu quốc gia, các chương trình dự án khác của Chính phủ.
8. Kinh phí hoạt động của các đơn vị sự nghiệp trực thuộc Tổng cục Hải quan thực hiện theo quy định tại Nghị định số 10/2002/NĐ-CP ngày 16 tháng 01 năm 2002 của Chính phủ.
9. Chi thực hiện tinh giản biên chế theo chế độ do Nhà nước quy định.