Điều 4: Vụ Đầu tư có Vụ trưởng và một số Phó Vụ trưởng. Vụ trưởng có trách nhiệm quản lý toàn diện công chức của Vụ; tổ chức học tập, bồi dưỡng nâng cao trình độ cho công chức; chịu trách nhiệm trước Bộ trưởng về toàn bộ hoạt động của Vụ.
Phó Vụ trưởng chịu trách nhiệm trước Vụ trưởng về nhiệm vụ được phân công.
Vụ Đầu tư có các phòng sau:
1- Phòng Chính sách - Tổng hợp
2- Phòng Đầu tư trung ương
3- Phòng Đầu tư địa phương
4- Phòng Quyết toán
Nhiệm vụ cụ thể của các Phòng do Vụ trưởng Vụ Đầu tư quyết định
Vụ Đầu tư tổ chức thực hiện công việc theo chế độ chuyên viên kết hợp với tổ chức phòng; đối với những công việc thực hiện theo chế độ chuyên viên, Vụ trưởng Vụ Đầu tư có trách nhiệm tổ chức công việc, phân công nhiệm vụ cho công chức phù hợp với chức danh, tiêu chuẩn, năng lực chuyên môn để hoàn thành nhiệm vụ được giao.
Biên chế của Vụ Đầu tư do Bộ trưởng Bộ Tài chính quyết định.