Điều 4. Về cơ chế tài chính: Trung tâm quản lý, khai thác và phát triển Quỹ đất tỉnh Hậu Giang là đơn vị sự nghiệp có thu tự bảo đảm toàn bộ chi phí hoạt động thường xuyên, thực hiện theo Nghị định số 10/2002/NĐ-CP ngày 16/01/2002 của Chính phủ về chế độ tài chính áp dụng cho đơn vị sự nghiệp có thu và Thông tư hướng dẫn thực hiện số 25/2002/TT-BTC ngày 21/03/2002 của Bộ Tài chính và Quyết định số 22/2003/QĐ-BTC ngày 18/02/2003 của Bộ trưởng Bộ Tài chính về cơ chế tài chính trong việc sử dụng quỹ đất tạo vốn xây dựng cơ sở hạ tầng.
Trong giai đoạn đầu mới thành lập (năm 2004 - 2005), Trung tâm quản lý, khai thác và phát triển quỹ đất tỉnh Hậu Giang được ngân sách Nhà nước hỗ trợ 100% kinh phí hoạt động. Khi Trung tâm đi vào hoạt động ổn định, thì Trung tâm lập đề án về cơ chế tài chính đơn vị sự nghiệp có thu tự bảo đảm toàn bộ chi phí hoạt động thường xuyên.