Điều 9:
1. Quỹ hỗ trợ hoạt động khu chế xuất và công nghiệp thành phố Hồ Chí Minh được quản lý tập trung tại một tài khoản mở tại Kho bạc nhà nước thành phố Hồ Chí Minh do Trưởng Ban Quản lý làm chủ tài khoản.
2. Ban Quản lý có trách nhiệm xây dựng Quy chế quản lý và sử dụng Quỹ Hỗ trợ hoạt động khu chế xuất và công nghiệp thành phố Hồ Chí Minh trình Uỷ ban Nhân dân thành phố Hồ Chí Minh phê duyệt sau khi có ý kiến thoả thuận của Bộ trưởng Bộ Tài chính.