Điều 3. Cơ cấu tổ chức
1. Lãnh đạo Viện:
Lãnh đạo Viện Khoa học kỹ thuật nông nghiệp duyên hải Nam Trung Bộ có Viện trưởng và các Phó Viện trưởng.
a) Viện trưởng do Bộ trưởng Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn bổ nhiệm theo đề nghị của Giám đốc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam. Viện trưởng điều hành Viện theo chế độ thủ trưởng, chịu trách nhiệm trước Giám đốc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam và trước pháp luật về toàn bộ hoạt động của Viện.
b) Phó Viện trưởng do Giám đốc Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam bổ nhiệm theo đề nghị của Viện trưởng. Phó Viện trưởng giúp việc Viện trưởng, chịu trách nhiệm trước Viện trưởng và trước pháp luật về thực hiện nhiệm vụ được Viện trưởng phân công.
2. Các phòng nghiệp vụ giúp Viện trưởng thực hiện nhiệm vụ:
a) Phòng Khoa học và Hợp tác quốc tế,
b) Phòng Tổ chức, Hành chính;
c) Phòng Tài chính Kế toán.
Các Phòng có Trưởng phòng và Phó trưởng phòng.
3. Các Bộ môn nghiên cứu:
a) Bộ môn Nghiên cứu cây lương thực;
b) Bộ môn Nghiên cứu cây thực phẩm;
c) Bộ môn Nghiên cứu hoa, cây cảnh;
d) Bộ môn Khoa học đất và môi trường;
e) Bộ môn Hệ thống nông nghiệp;
f) Bộ môn Chuyển giao công nghệ và Khuyến nông.
Các Bộ môn có Trưởng Bộ môn và Phó trưởng Bộ môn .
4. Các đơn vị trực thuộc Viện:
a) Trung tâm Nghiên cứu và phát triển cây lâu năm (cây lâu năm bao gồm: cây ăn quả, cây công nghiệp, cây lâm nghiệp); Trụ sở đặt tại xã Cát Hanh, huyện Phù Cát, tỉnh Bình Định;
b) Trung tâm Nghiên cứu Phát triển cây trồng bán khô hạn; Trụ sở đặt tại xã Phước Nam, huyện Ninh Phước, tỉnh Ninh Thuận; Các Trung tâm có Giám đốc và Phó Giám đốc; được sử dụng con dấu riêng, mở tài khoản theo uỷ quyền của Viện trưởng và quy định của pháp luật.
Các Trung tâm có Giám đốc và Phó Giám đốc; được sử dụng con dấu riêng, mở tài khoản theo uỷ quyền của Viện trưởng và quy định của pháp luật.