Điều 16 : Việc xử lý kỷ luật cán bộ, thanh tra vien, nhân viên nhằm mục đích giáo dục góp phần phòng ngừa, đấu tranh và xử lý nghiêm minh với những hành vi vi phạm quy định của Nhà nước, của UBND Thành phố và quy chế làm việc của cơ quan.
1- Cán bộ công chức, Thanh tra viên, nhân viên là công chức Nhà nước thuộc lực lượng Thanh tra Xây dựng khi vi phạm kỷ luật tuỳ theo mức độ sẽ phải chịu các hình thức kỷ luật: Khiển trách, cảnh cáo, hạ bậc lương, hạ ngạch lương, cách chức, buộc thôi việc theo quy định tại Nghị định 97/1998/NĐ-CP ngày 17/11/1998 của Chính phủ về kỷ luật và trách nhiệm vật chất đối với công chức.
2- Cán bộ, Thanh tra viên thuộc Thanh tra xây dựng quận, huyện và cán bộ chuyên trách quản lý trật tự xây dựng xã, phường, thị trấn, do thiếu trách nhiệm, không thực hiện đúng quy trình làm việc (không nắm địa bàn và phát hiện kịp thời các trường hợp xây dựng có sai phạm), được quy định tại điều 5, điều 6 chương II đến lần thứ hai, phải chịu hình thức kỷ luật thấp nhất là cảnh cáo, nếu tái phạm lần thứ ba phải chịu hình thức kỷ luật cách chức (đối với người có chức vụ) hoặc buộc thôi việc.
3- Đối với những người làm việc theo chế độ hợp đồng trong chỉ tiêu biên chế tại Thanh tra xây dựng khi vi phạm kỷ luật được xử lý theo Bộ Luật lao động và Nghị định số 41/CP ngày 6/7/1995 của Chính phủ về quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Bộ Luật lao động về kỷ luật lao động và trách nhiệm vật chất; tuỳ theo mức độ phạm lỗi bị xử lý theo một trong các hình thức sau: Khiển trách, chuyển sang làm việc khác, sa thải theo quy định của Bộ Luật lao động.