Điều 3. Cơ cấu tổ chức và biên chế:
1. Lãnh đạo Trung tâm:
Trung tâm Quan trắc, Phân tích tài nguyên và môi trường có Giám đốc và không quá 02 Phó Giám đốc.
- Giám đốc: Phụ trách chung và chịu trách nhiệm trước Giám đốc Sở Tài nguyên và Môi trường và pháp luật về toàn bộ những hoạt động của Trung tâm.
- Phó Giám đốc: được giám đốc phân công một số nhiệm vụ cụ thể, chịu trách nhiệm trước Giám đốc Trung tâm và trước pháp luật về những công việc thuộc các lĩnh vực được phân công.
Việc bổ nhiệm, miễn nhiệm, cách chức Giám đốc, các Phó giám đốc Trung tâm thực hiện theo quy định phân cấp công tác quản lý cán bộ của tỉnh
2. Các phòng chuyên môn.
- Phòng Kế hoạch - Tài chính.
- Phòng Quan trắc và phân tích.
- Phòng Nghiệp vụ, kỹ thuật.
Giám đốc Trung tâm xây dựng chức năng, nhiệm vụ và lề lối làm việc của các phòng chuyên môn trình cấp thẩm quyền quyết định.
Biên chế của Trung tâm được UBND tỉnh định biên trên cơ sở khối lượng công việc của Trung tâm đảm nhận, đảm bảo tinh gọn và hoạt động có hiệu quả. Trước mắt năm 2011 định biên: 08 người ( 02 lãnh đạo và mỗi phòng 02 người).
Trung tâm có thể tuyển lao động hợp đồng ngoài để đảm bảo hoàn thành nhiệm vụ được giao. Việc sử dụng lao động hợp đồng căn cứ vào yêu cầu công việc, khả năng nguồn kinh phí chi trả và theo quy định của pháp luật về hợp đồng lao động.
Về trình độ chuyên môn: phải đảm bảo trình độ đại học chính quy các chuyên ngành môi trường, chuyên ngành hóa phân tích, chuyên ngành công nghệ sinh học, chuyên ngành địa chất thủy văn, chuyên ngành kế toán...
3. Kinh phí hoạt động: Ngân sách tỉnh hỗ trợ kinh phí mua sắm ban đầu và đảm bảo kinh phí hoạt động trong 36 tháng đầu kể từ khi có quyết định thành lập.