Điều 4. Cục Tài chính doanh nghiệp có Cục trưởng phụ trách và một số Phó cục trưởng do Bộ trưởng Bộ Tài chính bổ nhiệm, miễn nhiệm.
Bộ máy của Cục Tài chính doanh nghiệp gồm có:
1. Ban Tài chính doanh nghiệp: Xây dựng, quốc phòng, an ninh, hải quan, dự trữ quốc gia, các tổ chức chính trị, chính trị - xã hội gọi tắt là Ban Tài chính doanh nghiệp xây dựng.
2. Ban Tài chính doanh nghiệp giao thông bưu điện
3. Ban Tài chính doanh nghiệp công nghiệp
4. Ban Tài chính doanh nghiệp Thương mại - Văn hoá - Giáo dục
5. Ban Tài chính doanh nghiệp nông nghiệp - Thuỷ sản
6. Ban Tài chính doanh nghiệp ngoài quốc doanh
7. Ban Cổ phần hoá
8. Ban Chính sách - Tổng hợp
9. Văn phòng Cục Nhiệm vụ cụ thể và biên chế của các đơn vị nói trên do Cục trưởng Cục Tài chính doanh nghiệp quy định.