Điều 3. Cơ cấu tổ chức
Lãnh đạo Phân viện có Phân Viện trưởng và một số Phó Phân viện trưởng.
Phân viện trưởng chịu trách nhiệm trước Viện trưởng về các nhiệm vụ được giao và chịu trách nhiệm trước pháp luật về mọi hoạt động của Phân viện; quy định chức năng, nhiệm vụ cụ thể của các tổ chức thuộc Phân viện; xây dựng quy chế làm việc và điều hành mọi hoạt động của Phân viện.
Phó Phân viện trưởng giúp việc Phân viện trưởng và chịu trách nhiệm trước Phân viện trưởng về nhiệm vụ công tác được phân công.
Tổ chức và biên chế của Phân viện Nghiên cứu Địa chất và Khoáng sản phía Nam do Viện trưởng Viện Nghiên cứu Địa chất và Khoáng sản quy định.
Phân viện Nghiên cứu Địa chất và Khoáng sản phía Nam có con dấu riêng, được mở tài khoản theo quy định hiện hành.
Trụ sở của Phân viện Nghiên cứu Địa chất và Khoáng sản đóng tại số 2B, đường Lê Lai, quận Gò Vấp, thành phố Hồ Chí Minh.