Điều 3. Về tổ chức bộ máy và biên chế:
1. Tổ chức bộ máy:Trung tâm có giám đốc, 1 đến 2 phó giám đốc giúp việc; Việc bổ nhiệm giám đốc, phó giám đốc Trung tâm thực hiện theo quy định phân cấp quản lý cán bộ hiện hành của Nhà nước và của Thường vụ Tỉnh uỷ;
Giao Giám đốc Ban quản lý Vườn Quốc gia Phong Nha - Kẻ Bàng thành lập các bộ phận giúp việc và các đơn vị trực thuộc Trung tâm tinh gọn, hiệu quả; cán bộ, viên chức của Trung tâm được tuyển dụng bố trí phải căn cứ cơ cấu, tiêu chuẩn chức danh chuyên môn và đáp ứng tốt yêu cầu nhiệm vụ.
2. Biên chế: Biên chế của Trung tâm được bố trí trong chỉ tiêu UBND tỉnh giao hàng năm cho Ban quản lý Vườn Quốc gia Phong Nha - Kẻ Bàng.