Điều 3. Cơ cấu tổ chức của Bộ
a) Các tổ chức giúp Bộ trưởng thực hiện chức năng quản lý nhà nước :
1. Vụ Đất đai;
2. Vụ Đăng ký và Thống kê đất đai;
3. Vụ Môi trường;
4. Vụ Thẩm định và Đánh giá tác động môi trường;
5. Vụ Khí tượng Thuỷ văn;
6. Vụ Khoa học - Công nghệ;
7. Vụ Kế hoạch - Tài chính;
8. Vụ Hợp tác quốc tế;
9. Vụ Pháp chế;
10. Vụ Tổ chức cán bộ;
11. Cục Quản lý tài nguyên nước;
12. Cục Địa chất và Khoáng sản Việt Nam;
13. Cục Bảo vệ môi trường;
14. Cục Đo đạc và Bản đồ;
15. Thanh tra;
16. Văn phòng.
b) Các tổ chức sự nghiệp thuộc bộ :
1. Trung tâm Khí tượng Thuỷ văn quốc gia;
2. Trung tâm Điều tra quy hoạch đất đai;
3. Trung tâm Viễn thám;
4. Trung tâm Thông tin;
5. Tạp chí Tài nguyên và Môi trường;
6. Báo Tài nguyên và Môi trường;
Bộ trưởng Bộ Tài nguyên và Môi trường chủ trì, phối hợp với Bộ trưởng Bộ Nội vụ xây dựng phương án sắp xếp các viện : Viện nghiên cứu Địa chất và Khoáng sản Việt Nam, Viện Khoa học Địa chính, Viện Khoa học Khí tượng Thuỷ văn và các trường hiện có thuộc Tổng cục Địa chính, Tổng cục Khí tượng Thuỷ văn, trình Thủ tướng Chính phủ quyết định.