Công văn số 7451/CT-QLNT Về thuế giá trị gia tăng

Kính gửi:

- Thuế tỉnh Ninh Bình;

- Công ty TNHH MTV Thương mại và Sản xuất Gia

Phúc Đồng Văn (Địa chỉ: A32-TT6-Khu đô thị Văn

Quán, Yên Phúc, phường Hà Đông, TP Hà Nội).

Cục Thuế nhận được đơn kiến nghị ngày 15/9/2026 và văn bản số 05/2026/CV-GPĐV ngày 02/10/2026 của Công ty TNHH MTV Thương mại và Sản xuất Gia Phúc Đồng Văn về thuế giá trị gia tăng (GTGT). Về vấn đề này, Cục Thuế có ý kiến như sau:

Căn cứ khoản 2 Điều 5 Luật Thuế GTGT số 13/2008/QH12 ngày 03/6/2008 quy định đối tượng không chịu thuế;

Căn cứ Điều 12 Luật Thuế GTGT số 13/2008/QH12 được sửa đổi, bổ sung tại khoản 6 Điều 1 Luật số 31/2013/QH13 ngày 19/6/2013 quy định khấu trừ thuế GTGT đầu vào;

Căn cứ khoản 2 Điều 4, khoản 1, khoản 7, khoản 9 Điều 14 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính hướng dẫn đối tượng không chịu thuế GTGT, nguyên tắc khấu trừ thuế giá trị gia tăng đầu vào;

Căn cứ khoản 5 Điều 18 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính được sửa đổi, bổ sung tại khoản 3 Điều 1 Thông tư số 130/2016/TT-BTC ngày 12/8/2016 của Bộ Tài chính hướng dẫn đối tượng và trường hợp được hoàn thuế GTGT.

Ngày 06/6/2025, Chi cục khu vực IV (Nay là Thuế tỉnh Ninh Bình) đã có công văn số 1927/CCTKV04-QLDN2HNA gửi Công ty Gia Phúc Đồng Văn về khấu trừ và hoàn thuế GTGT, trong đó có nêu rõ: “Căn cứ các quy định trên và hồ sơ Công ty cung cấp, Công ty được Ban Quản lý các KCN tỉnh Hà Nam cấp Giấy chứng nhận đầu tư để thực hiện Dự án nhà máy sản xuất hạt giống chất lượng cao, mục tiêu của Dự án là sản xuất hạt giống chất lượng cao thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT thì số thuế GTGT đầu vào không được khấu trừ, không được hoàn thuế.”

Pháp luật thuế GTGT đã quy định rõ về nguyên tắc khấu trừ thuế GTGT đầu vào: Thuế GTGT đầu vào của hàng hoá, dịch vụ sử dụng đồng thời cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế và không chịu thuế thì chỉ được khấu trừ số thuế GTGT đầu vào của hàng hoá, dịch vụ sử dụng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT. Trường hợp cơ sở kinh doanh chấm dứt hoạt động và không phát sinh thuế GTGT đầu ra của hoạt động kinh doanh chính thì phải nộp lại số thuế đã được hoàn vào ngân sách nhà nước. Trường hợp có phát sinh bán tài sản chịu thuế GTGT thì không phải điều chỉnh lại số thuế GTGT đầu vào tương ứng của tài sản bán ra. Ngày 12/8/2026, Cục Thuế đã có công văn số 5817/CT-CS gửi Thuế tỉnh Ninh Bình (bản photo kèm theo).

Đề nghị Công ty TNHH MTV Thương mại và Sản xuất Gia Phúc Đồng Văn căn cứ các quy định tại pháp luật thuế GTGT và các văn bản hướng dẫn của cơ quan thuế để thực hiện theo quy định. Trường hợp có vướng mắc, đề nghị Công ty liên hệ với cơ quan thuế quản lý trực tiếp để được hướng dẫn thực hiện theo quy định và theo thẩm quyền.

Cục Thuế có ý kiến để Thuế tỉnh Ninh Bình và Công ty TNHH MTV Thương mại và Sản xuất Gia Phúc Đồng Văn được biết./.